ماجستير دراسات المرأة يسعى لتقديم برنامج دراسي يؤدي إلى شهادة الماجستير في دراسات المرأة، وذلك لأهمية دور المرأة في المجتمع حيث أنها تشكل أكثر من 50% من عدد السكان، ولأنها العمود الأساس في العملية التربوية بأبعادها المختلفة، ولدورها الريادي والنضالي في بناء المؤسسات المدنية والسياسية والاجتماعية.
ونظراً لإيمان الجامعة بأهمية دور المرأة بشكل عام، وتميز المرأة الفلسطينية بشكل خاص، فقد عملت على استحداث برنامج جديد عن المرأة يغطي الموضوعات المختلفة في مجالات القانون، وعلم النفس، وعلم الاجتماع، والخدمة الاجتماعية التي تؤهل المرأة لتحقيق دورها الريادي المنشود في المجتمع الفلسطيني.