يسعى برنامج الدكتوراة في أصول الدين إلى جذب الطلبة الراغبين في زيادة التحصيل المعرفي في التفسير والحديث، وبخاصة الذين أنهوا مرحلة الماجستير في تخصص أصول الدين وما يعادله. وينقسم هذا البرنامج إلى مسارين. الأول في التفسير والدراسات القرآنية، والثاني في الحديث الشريف وعلومه.

ويهدف هذا البرنامج ل:

1. ترسيخ القاعدة العلمية التخصصية في مجال التفسير والحديث لدى الطالب.
2. تنمية القدرة على البحث والنظر في المسائل العلمية الدقيقة ذات العلاقة بالقرآن الكريم والسنة النبوية.
3. تمكين الطالب من إجراء البحوث والدراسات في علوم القرآن والحديث على نحو يثري المعرفة في هذا التخصص.
4. تنمية قدرات الدارسين في التعامل مع وقائع العصر ومستجداته.
5. إبراز أصالة الدراسات القرآنية والحديثية، وبيان قدرتها على إيجاد الحلول لكثير من مشكلات العصر.