يعد برنامج الماجستير في الآثار من البرامج النادرة والوحيدة في الجامعات الفلسطينية. ونظراً لأهميته في كتابة الرواية التاريخية الفلسطينية فقد اختارت جامعة النجاح الوطنية هذا البرنامج الوطني بامتياز ليكون أحد أهم برامجها التي تطرحها للطلبة الخريجين الراغبين العمل في المؤسسات العاملة في مجال التراث الثقافي من مؤسسات حكومية أو خاصة، حيث فرص العمل متشعبة موزعة على المتاحف الحكومية والخاصة. إضافة إلى الشركات العاملة في مجال صيانة المباني القديمة وترميمها وفي البلديات. وكذلك العمل في المشاريع الدولية والبعثات الأثرية التي تقوم بإجراء التنقيبات الأثرية في المواقع الأثرية الفلسطينية التي تعود إلى فترات زمنية وثقافات مختلفة بدءاً من بداية الحياة البشرية على أرض فلسطين التاريخية وصولاً إلى نهاية فترتي الحكم العثماني والحرب العالمية الأولى.