يعد برنامج الماجستير في الآثار من البرامج النادرة والوحيدة في الجامعات الفلسطينية. ونظراً لأهميته في كتابة الرواية التاريخية الفلسطينية فقد اختارت جامعة النجاح الوطنية هذا البرنامج الوطني بامتياز ليكون أحد أهم برامجها التي تطرحها للطلبة الخريجين الراغبين العمل في المؤسسات العاملة في مجال التراث الثقافي من مؤسسات حكومية أو خاصة، حيث فرص العمل متشعبة موزعة على المتاحف الحكومية والخاصة. إضافة إلى الشركات العاملة في مجال صيانة المباني القديمة وترميمها وفي البلديات. وكذلك العمل في المشاريع الدولية والبعثات الأثرية التي تقوم بإجراء التنقيبات الأثرية في المواقع الأثرية الفلسطينية التي تعود إلى فترات زمنية وثقافات مختلفة بدءاً من بداية الحياة البشرية على أرض فلسطين التاريخية وصولاً إلى نهاية فترتي الحكم العثماني والحرب العالمية الأولى.
نعرض بعض الأهداف التي يتطلع إليها البرنامج على النحو الآتي:
1. تزويد القطاعات والمؤسسات المحلية ذات العلاقة مثل: وزارة التربية والتعليم العالي، ووزارة السياحة والآثار، والشرطة السياحية بكادر علمي مؤهل يساهم في تلبية احتياجات المجتمع وتطوره إلى الأفضل في مجال حماية وتطوير قطاع الآثار في فلسطين.
2. تقديم تعليم متميّز في مجال الآثار، يُعزّزه البحث العلميّ الموجه لخدمة حاجات المجتمع الفلسطيني.
3. تعزيز الرواية التاريخية الفلسطينية من خلال الدراسات والأبحاث الأثرية.
4. غرس قيم المجتمع الإسلامي ومبادئه وأخلاقياته، مثل التسامح والتفاهم بين الحضارات، عن طريق دراسة الحضارات المختلفة وفهما.
5. العمل كمصدر ثقافي وتعليمي لفهم التراث والتاريخ الفلسطيني ونشرهما.
6. غرس مفهوم التعددية الثقافيّة لدى الطلاب وتزويدهم بالآليات التي تكفل لهم التعامل المؤثر مع مجتمع عالميّ متزايد التعقيد ومتسارع التغيير.
7. ترسيخ مهارات الاتصال الفعّال والتفكير الناقد، وغيرها من المهارات الأخرى التي تمكن الخريجين من الأداء المثمر في مجال الحياة العمليّة.
8. تنمية إستراتيجية القدرة على حل المشكلات والعمل في مواقع تتباين في إمكاناتها ، والاستفادة مما هو متوفر في البيئة المحيطة في الآثار.