برنامج ماجستير الصيدلة المجتمعية هو البرنامج الذي سيعمل على تغيير نمط مهنة ممارسة الصيدلة في فلسطين والإرتقاء بها لتصل الى مستوى قريب من مهنة الصيدلة في الدول المتقدمة وذلك من خلال إدخال مفاهيم الممارسة الصيدلانية المجتمعية الحديثة.

ومن الأهداف الرئيسية للبرنامج:

1.  تزويد المجتمع الفلسطيني بصيادلة ذووي كفائة عالية في مجال تقديم الرعاية الصيدلانية والخدمات الصيدلانية المجتمعية.
2.  تطوير القدرات الإدارية الصيدلانية للعاملين في القطاع الصيدلاني المجتمعي.
3.  تعزيز العلاقة المهنية بين الصيدلاني والمريض بدلا من العلاقة التجارية وتقديم خدمات صيدلانية نوعية وذات جودة عالية في المؤسسات الصيدلانيه المجتمعية.
4.  خلق إطار علمي لإجراء الدراسات الخاصة بالممارسة الصيدلانية المجتمعية والتي تفتقر لها فلسطين
5.  العمل على ترشيد إستهلاك الدواء في المجتمع الفلسطيني من خلال تعزيز دور الصيدلاني في صيدليات المجتمع وبإسلوب علمي مهني حديث.
6. إنشاء قاعدة بيانات خاصة بالممارسة والواقع الدوائي في فلسطين حيث لا يوجد مثل هذا البيانات حاليا في فلسطين ويمكن تطوير ذلك ليصبح مركزا متخصصا يتم من خلاله ممارسة واقع الدواء في المجتمع الفلسطين بالمجتمعات الأخرى مع السلبيات والايجابيات
7.  تطوير التعليم الصيدلاني في فلسطين ليتكامل مع الدراسات والتخصصات الصيدلانية الأخرى وبالذات الصيدلة السريرية حيث أن برنامج الصيدلة السريرية قد ساهم وبشكل واضح في تعزيز وتطوير العمل الصيدلاني في المستشفيات الفلسطينية.